1934
В 1934 году Япония начала строительство порта Сисука.
1946
В 1946 году остров Сахалин входит в состав СССР, а в городе Поронайск создается управление морского торгового порта Поронайск.
1950
Первоначально порт Поронайск находится в подчинении Макаровского торгового порта, а в 1950 году получает статус самостоятельного морского порта. Уже в 1951 году его открывают для международного сообщения, а в 1955 году Поронайский морской торговый порт реорганизуют, и он становится порт пунктом Корсаковского морского торгового порта.
1957
В 1957 году морская гавань вновь приобретает самостоятельность, он становится портом III разряда.
1960-70
В 1960-70 годах в порту проводятся ремонтно-строительные работы, направленные на повышение показателей по грузоперевозкам.
1980-90
В 1980-90 годах ежегодная перевалка грузов в порту достигает рекордных показателей - 1 млн тонн. С учетом особенностей устья реки Поронай, в котором расположены портовые мощности, большинство операций в те годы осуществляется на рейде. Основу грузооборота порта составляют лес и продукция бумажного комбината, рыбная продукция, цемент, песчано-гравийная смесь и товары народного потребления. Порт также используется для пассажирского транспортного сообщения в пределах города Поронайск.
1990
В 1990 годы в рамках приватизационных процессов происходит реорганизация порта. Мощности морского порта Поронайск значительно снижаются из-за закрытия производственных предприятий региона и дефицита бюджетного финансирования.
2003-08
В 2003 году в результате создания единого хозяйствующего субъекта ФГУП «Росморпорт» образуется Сахалинский филиал предприятия, который приступил к хозяйственной деятельности в порту в 2004 году.Распоряжением Правительства Российской Федерации от 20 ноября 2008 г. № 1724-р подтверждается статус пункта пропуска в порту Поронайск (номер в списке 378).
2010
В апреле 2010 году устанавливаются границы порта, а в июле этого же года сведения о гавани включаются в Реестр морских портов Российской Федерации.
2013-14
В 2013-2014 году порт заносится в списки пропуска через государственную границу.
2015
С ноября 2015 года в морском порту Поронайск появляется новый собственник – профильный холдинг «Развитие транспортных проектов». Управляющей компанией становится ООО «Порт Поронайск».